Вспышки инфекций, вызванных штаммами Candida auris: анализ и прогноз (часть 3)

Динамика колонизации и заражения C. auris

Факторы риска заражения C. auris не отличаются от факторов риска заражения другими видами Candida. К ним относятся длительное пребывание в условиях высокого риска, таких как отделения интенсивной терапии, и тяжелые сопутствующие заболевания, такие как ВИЧ, нейтропения, хроническая болезнь почек и сахарный диабет. К другим важным факторам относятся наличие катетеров, искусственная вентиляция легких, длительное лечение антибиотиками или противогрибковыми препаратами и инвазивная хирургия.

C. auris – это условно-патогенный микроорганизм с клиническим спектром, аналогичным спектру других видов рода Candida. Спектр инфекции Candida варьируется от бессимптомной колонизации до поверхностной и инвазивной инфекции. Последняя чаще всего ассоциируется с учреждениями здравоохранения. Candida auris не является комменсальным дрожжевым грибком, но может сохраняться на коже человека и абиотических поверхностях в течение длительных периодов. Эта устойчивость привела к значительным вспышкам в учреждениях здравоохранения, поскольку дрожжевой грибок легко передается через контакт с загрязненными предметами или через кожный контакт с инфицированными людьми. По данным CDC, пациенты должны проходить скрининг на колонизацию C. auris, если они были госпитализированы в медицинское учреждение в течение последнего года или если они были госпитализированы в медицинское учреждение за рубежом и инфицированы грамотрицательными бактериями, продуцирующими карбапенемазу. Это связано с тем, что совместная колонизация C. auris с этими микроорганизмами очень распространена, особенно в странах с зарегистрированными случаями C. auris. Хотя скрининг при поступлении в больницу не является рутинным, имеются веские доказательства, подтверждающие важность скрининга всех пациентов в критическом состоянии. Это особенно важно для пациентов с хроническими респираторными заболеваниями, которые подвергаются значительному риску колонизации, особенно в районах, где C. auris является эндемичным. Различные исследования показали, что выписанным из медицинских учреждений пациентам обычно требуется около восьми месяцев, чтобы освободиться от колонизации. Однако пациенты, которые остаются в медицинских учреждениях, часто продолжают испытывать стойкую колонизацию.

Идентификация и типирование

Идентификация C. auris биохимическими методами может быть сложной, если тест не был обновлен для включения C. auris из-за фенотипического сходства с другими видами, такими как C. haemulonii, C. duobushaemulonii, C. lusitaniae и C. famata. Отличной альтернативой стандартным грибковым средам для скрининга пациентов, потенциально колонизированных/инфицированных C. auris, является CHROMagar Candida Plus. При 36 часах инкубации чувствительность и специфичность метода составляют 100%, при этом колонии C. auris приобретают светло-голубой цвет с синим ореолом. Варианты идентификации видов включают в себя времяпролетную масс-спектрометрию с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF) и молекулярные методы. Альтернативными методами, которые также можно использовать, являются полимеразная цепная реакция в реальном времени (ПЦР) и петлевая изотермическая амплификация (LAMP). Однако при расследовании вспышки необходимы методы более высокого разрешения, такие как анализ последовательности всего генома и типирование с помощью полиморфизма длины амплифицированного фрагмента (AFLP), для определения пути передачи заболевания в популяции и предоставления информации о вероятном источнике. Для идентификации видов рекомендуются либо MALDI-TOF MS, либо методы на основе ДНК, как зависимые, так и независимые от секвенирования. Для контроля вспышек в больницах необходимо типирование, требующее сложных диагностических инструментов, таких как мультилокусное типирование последовательностей (MLST) или секвенирование всего генома (WGS). После идентификации C. auris следует немедленно принять меры предосторожности для предотвращения передачи.